研究工作流
如何用论文与 PDF 建立可追溯的研究知识库
从一组已经选定的论文建立研究知识库，保留文献矩阵、方法、局限、矛盾、引用与来源更新。
文章封包
Workflows
已经选好一组论文，希望整理文献又不丢失引用、矛盾与研究局限的学生和研究者
8 分钟阅读
01
先固定一个研究问题和一组已经取得的论文，不把自动找文献混入同一工作。
02
每个主张、方法、样本、结果与局限都回到准确页面或段落。
03
新论文加入时分别更新共识、矛盾与未知，不重写成一段流畅结论。
01
先回答：研究知识库应该保存什么
从一个研究问题和一组已经选定的论文开始。原始论文保持权威，研究知识库保存可检查的文献矩阵：主张、方法、样本、结果、局限、准确来源位置与当前验证状态。
这不是请 AI 代写文献综述。真正有用的产物会把一致、矛盾与未知分开，让下一位读者能从每个综合结论回到原文重新判断。
02
先把来源范围缩到能逐项验证
只加入当前研究问题需要的论文。Wenlan 可以读取 Markdown、文本文件、可直接提取文字的 PDF、文件夹与只读 Obsidian vault；图片型或扫描 PDF 必须先在外部完成 OCR。
Wenlan 不会搜索学术数据库、查找 DOI、导入 Zotero、设置参考文献格式或判断研究质量。选文、方法评估、统计解读与学术诚信仍由研究者负责。
03
建立可以重做的文献矩阵
每个重要结果各占一行，不要先写成一段总结。字段至少包含 paper、claim、method、sample、result、limitation、page 或 section、版本与验证状态。
- 研究问题与纳入范围：说明这一轮包含和排除了哪些论文。
- 方法与样本：避免把不同设计和人群直接合并。
- 结果与局限：把作者实际报告和你的解读分开。
- 引用位置：保存页码、段落、source ID 与能取得的版本。
- 证据状态：标记支持、部分支持、无依据、矛盾或待查。
完成 Wenlan 与 AI 客户端设置后
wenlan status
wenlan sources add ~/Research/papers
/distill <研究问题>
/pages <研究问题>
/lint
/curate04
不要把矛盾与局限磨成假共识
两篇论文结果不同时，先比较样本、方法、时间、适用范围与局限，再判断能否形成更窄的结论。证据不足就保留未知，不要为了让笔记好读而补成一致答案。
重要数字、否定词、作者归属和范围都要打开引用段落核对。引用存在只代表有路径，不代表来源本身正确，也不代表它完整支持这句话。
05
新论文加入时只刷新受影响的综合
加入新论文或替换修订版后，重新同步来源，标出哪些矩阵行和结论受到影响，再生成可审核的 Page 修订。保留旧版本与变更原因，才能看出知识如何变化。
最后保留一份人能直接阅读的研究笔记。Wenlan 可以维护来源、Page、引用、stale 状态与修订，但研究者仍负责解读、引用格式与最终写作。
先建立一份能逐项检查的研究笔记
加入一组有界论文、建立文献矩阵，再确认每个重要综合都能回到当前来源。
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