研究工作流
如何用論文與 PDF 建立可追溯的研究知識庫
從一組已選定的論文建立研究知識庫，保留文獻矩陣、方法、限制、矛盾、引用與來源更新。
文章封包
Workflows
已經選好一組論文，希望整理文獻又不失去引用、矛盾與研究限制的學生及研究者
8 分鐘閱讀
01
先固定一個研究問題與一組已取得的論文，不把自動找文獻混進同一工作。
02
每個主張、方法、樣本、結果與限制都回到確切頁面或段落。
03
新論文加入時分開更新共識、矛盾與未知，不重寫成一段順暢結論。
01
先回答：研究知識庫要保存什麼
從一個研究問題和一組已選定的論文開始。原始論文保持權威，研究知識庫保存可檢查的文獻矩陣：主張、方法、樣本、結果、限制、確切來源位置與目前驗證狀態。
這不是請 AI 代寫文獻回顧。真正有用的產物會把同意、矛盾與未知分開，讓下一位讀者能從每個綜合結論回到原文重做判斷。
02
先把來源範圍縮到能逐項驗證
只加入目前研究問題需要的論文。Wenlan 可讀 Markdown、文字檔、可直接擷取文字的 PDF、資料夾與唯讀 Obsidian vault；影像型或掃描 PDF 必須先在外部完成 OCR。
Wenlan 不會搜尋學術資料庫、找 DOI、匯入 Zotero、替引用排格式或判斷研究品質。選文、方法評估、統計判讀與學術誠信仍由研究者負責。
03
建立可重做的文獻矩陣
每個重要結果各佔一列，不要先寫成一段總結。欄位至少包含 paper、claim、method、sample、result、limitation、page 或 section、版本與驗證狀態。
- 研究問題與納入範圍：說明這一輪包含與排除哪些論文。
- 方法與樣本：避免把不同設計和母體直接合併。
- 結果與限制：把作者實際報告和你的解讀分開。
- 引用位置：保存頁碼、段落、source ID 與可取得的版本。
- 證據狀態：標記支持、部分支持、無依據、矛盾或待查。
完成 Wenlan 與 AI 客戶端設定後
wenlan status
wenlan sources add ~/Research/papers
/distill <研究問題>
/pages <研究問題>
/lint
/curate04
不要把矛盾與限制磨成假共識
兩篇論文結果不同時，先比較樣本、方法、時間、適用範圍與限制，再決定是否能形成更窄的結論。證據不足就保留未知，不要為了讓筆記好讀而補成一致答案。
重要數字、否定詞、作者歸屬和範圍都要打開引用段落核對。引用存在只代表有路徑，不代表來源本身正確，也不代表它完整支持這句話。
05
新論文加入時只刷新受影響的綜合
加入新論文或替換修訂版後，重新同步來源，標出哪些矩陣列和結論受影響，再產生可審查的 Page 修訂。保留舊版本與變更原因，才能看出知識如何改變。
最後保留一份人能直接閱讀的研究筆記。Wenlan 可以維護來源、Page、引用、stale 狀態與修訂，但研究者仍負責解讀、引用格式與最終寫作。
先建立一份可逐項檢查的研究筆記
加入一組有界論文、建立文獻矩陣，再確認每個重要綜合都能回到目前來源。
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